Stowarzyszenie SOISH działa na rzecz społeczeństwa, poprzez monitoring w obszarze stosunków państwa z kościołami i innymi związkami wyznaniowymi. Cele są realizowane poprzez kontrolę obywatelską, badanie wzajemnych relacji, badanie finansowania, przygotowywanie propozycji zmian w prawie wyznaniowym, działalność naukową i ekspercką oraz badanie stopnia przestrzegania prawa przez władze publiczne. Stowarzyszenie SOISH jest apolityczne i neutralne w kwestiach wiary i światopoglądu.
Czyli: A. patrzymy władzy i kościołom na ręce; B. sprawdzamy przepływy finansowe; C. pilnujemy równouprawnienia obywateli bez względu na wyznanie lub jego brak; D. piszemy i raportujemy o sprawach wolności sumienia i wyznania; E. i prowadzimy wiele innych działań.